Pudełko Medaka

Fabuła opowiada o Medace Kurokami, magnetycznej i atrakcyjnej uczennicy pierwszego roku Akademii Hakoniwa, która została wybrana na przewodniczącą Samorządu Uczniowskiego z 98% głosów. Odnosi się do tych petycji w swój niewłaściwy sposób i przy całej pomocy swojego kumpla z dzieciństwa Zenkichi Hitoyoshi zakłada skrzynkę sugestii. W trakcie narracji miejsca przywódców samorządu uczniowskiego są przez nią rozdzielane między innych uczniów, takich jak Mogana Kikaijima i Kouki Akune.

Samorząd Uczniowski dowiaduje się, że przewodniczący akademii zamierza zainicjować pracę nad potężnymi eksperymentami na rutynowych uczniach, Planem Kolby, zwanym Normalnymi, abyś mógł zmienić ich w Nienormalnych, czyli ludzi o nadludzkich mocach. Samorząd Uczniowski wchodzi w konflikt z innymi uczniami zaangażowanymi w pracę i infiltruje tajne laboratorium szkoły.

Wkrótce potem Misogi Kumagawa, który chce zastąpić Samorząd Uczniowski jednym ze swoich własnych Medaka, rzuca wyzwanie Samorządowi Uczniowskiemu o mistrzostwo. Dzięki jego mocy dwóch uczniów zostaje odpieczętowanych po pokonaniu Kumagawy i kończy transport do Akademii Hakoniwa. Ta dwójka jest zwykle silniejsza niż anormalni i nazywana jest „Not Equals”. Ich przywódca, Anshin'in, grozi wznowieniem Planu Flask, gdy Medaka ukończy studia, zmuszając ich następców do szkolenia przez Radę Uczniowską. Niemniej jednak właściwą strategią Anshin'in byłoby, aby stanowisko Przewodniczącego Samorządu Uczniowskiego Zenkichi uzurpowało sobie Medakę. Zenkichi odnosi sukces i robi to pod pretekstem poprawy życia studenckiego. Przekonuje Medakę, aby zezwolił na Plan Kolby tym ludziom, którzy nie są niechętni.

Przejęta od obowiązków przewodniczącej Samorządu Uczniowskiego, Medaka wkrótce angażuje się w mistrzostwa, aby ustalić męża. Medaka zostaje zwycięzcą, decydując się poślubić Zenkichiego po tym, jak oboje ukończyli szkołę i przystąpili do niej. Wkrótce potem bliski kumpel Hansode Shiranui z Zenkichi opuszcza szkołę. Zenkichi i medaka dowiadują się, że będzie kolejnym gospodarzem Iihiko Shishime, 5000-letniej istoty. Zostaje pokonany przez medakę i znika po opuszczeniu księżyca przed uderzeniem w Ziemię, aby po prostu pojawić się ponownie na czas nabożeństwa na koniec roku. Po jej powrocie zajmij pozycję jej ojca, wyprzedzając konglomerat firm jej rodziny, Grupę Kurokami, by później wrócić, gdy nowa przewodnicząca i Medaka postanawiają opuścić akademię. Dziesięć lat później Zenkichi awansował w Grupie Kurokami, stając się pracownikiem wysokiego szczebla, zanim ponownie się z nią połączył, a obaj przysięgli, że nigdy więcej się nie rozstaną.