Marie jest uwięziona w strasznej sytuacji. Jest nieustannie dręczona przez swoich kolegów z klasy i regularnie molestowana przez swojego nauczyciela. Nie mając dokąd się zwrócić, prosi o nadprzyrodzoną pomoc jednego z siedmiu demonów z siedmiu tajemnic jej szkoły. Wszystko, czego pragnie, to śmierć jej okrutnych kolegów z klasy i nauczyciela. Jak daleko będzie skłonna posunąć się Marie, aby dokonać morderstw, które uwolnią ją od piekła życia?
Higanbana no Saku Yoru ni odbywa się w nienazwanym środowisku szkolnym i składa się z wielu samodzielnych opowiadań, z których każda jest opowiadana z perspektywy ucznia lub członka personelu szkoły. W tych opowieściach głównym tematem jest nękanie, ponieważ bohater każdej historii jest przedstawiany jako ofiara znęcania się lub sam tyran. Higanbana obraca się wokół serii miejskich legend wywołanych przez nadprzyrodzone istoty zwane y? Kai, z których każda twierdzi, że jest właścicielem jakiejś „tajemnicy” i zabija każdego, kto próbuje ją zbadać. Na początku serii jest w sumie siedem „tajemnic”, z wieloma y? Kai walczącymi ze sobą w toczącej się wojnie o własność tych tajemnic, która jest przyznawana siedmiu y? Kai, którzy zwyciężyli w konflikcie. . Bohaterowie opowieści wchodzą w interakcję z co najmniej jednym z mieszkających w szkole Y? Kai, którzy zmuszają bohaterów do radzenia sobie z konsekwencjami swoich działań w zakresie zastraszania.
